21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1405 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16330  hypothetical protein  92.04 
 
 		 568 aa  1014    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1405  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1146    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0788  hypothetical protein  23.64 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0367203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1665  KWG  25.77 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231583  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2114  KWG repeat protein  24.11 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7250  KWG repeat protein  26.44 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0105144  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2595  KWG repeat protein  23.81 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0718  KWG repeat protein  24.58 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2057  hypothetical protein  22.45 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.929544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1549  KWG repeat protein  23.08 
 
 		 419 aa  53.9  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00077651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0331  hypothetical protein  24.87 
 
 		 665 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0728  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.96 
 
 		 906 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1214  hypothetical protein  32 
 
 		 491 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330729  normal  0.357584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3778  KWG Leptospira repeat protein  22.83 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1452  KWG repeat-containing protein  23.87 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00334104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0521  phospholipase A  22.99 
 
 		 380 aa  48.5  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0751  KWG repeat protein  23.47 
 
 		 340 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1920  hypothetical protein  24.7 
 
 		 297 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.20154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3973  KWG repeat protein  21.41 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.0396525 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0887  hypothetical protein  22.98 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00618289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0721  KWG repeat protein  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.430141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>