285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4752 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  100 
 
 		 435 aa  902    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  43.85 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  44.3 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  43.21 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  43.24 
 
 		 422 aa  339  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  44.16 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  44.59 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  43.81 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  40.21 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  37.43 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  36.76 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  37.9 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  29.62 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  27.09 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  28.03 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  25.07 
 
 		 449 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  26.15 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  28.12 
 
 		 424 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2852  Xaa-Pro aminopeptidase-like protein  32.32 
 
 		 229 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  28.21 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  27.46 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  27.46 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  26.35 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.09 
 
 		 356 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3845  peptidase M24  27.97 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.74 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  27.3 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  28.4 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  22.72 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.23 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  24.35 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2421  peptidase M24  25.94 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  26.69 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.05 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  28.34 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  26.18 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  26.18 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  26.18 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3747  putative dipeptidase  26.25 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.93962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3478  peptidase M24  26.25 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  29.41 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.81 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  30.07 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  30.07 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  30.07 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  30.07 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  26.38 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  27.12 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.82 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  29.41 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  22.42 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  22.22 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  24.47 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  22.68 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  29.41 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  27.91 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  28.76 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  22.16 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  22.16 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  25.52 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2404  peptidase M24  26.28 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.28 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2398  peptidase M24  26.28 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.701554  normal  0.365978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  22.43 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.64 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  28.76 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.16 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  22.16 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25.1 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  22.16 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  23.62 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  23.04 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.51 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  28.08 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  28.31 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  23.99 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  24.8 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  26.14 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.6 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.09 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.86 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  23.99 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  25.1 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.7 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  25.45 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>