43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1586 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16841  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  88.76 
 
 		 90 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0341697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16971  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  87.64 
 
 		 90 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208572  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16731  hypothetical protein  67.74 
 
 		 63 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16151  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.13 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04141  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.36 
 
 		 92 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1024  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.36 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18941  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.26 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2080  hypothetical protein  36.71 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.567469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0593  hypothetical protein  31.87 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  26.19 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  32.05 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2711  protein of unknown function DUF448  32.05 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3392  protein of unknown function DUF448  32.05 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17391  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  29.41 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0598  hypothetical protein  30.12 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2021  hypothetical protein  27.63 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.158983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1869  hypothetical protein  35.38 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  33.8 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  26.67 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  31.17 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  27.69 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  32.91 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2090  protein of unknown function DUF448  32.35 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  26.92 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  25.64 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  27.78 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  30.11 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  29.87 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  30.12 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3977  hypothetical protein  29.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  26.67 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  29.11 
 
 		 90 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  25.3 
 
 		 93 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2358  protein of unknown function DUF448  25 
 
 		 84 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  26.09 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  32.22 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  28.41 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  25.61 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  28.41 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>