48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64224 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_64224  translation initiation factor eIF2B subunit  100 
 
 		 467 aa  971    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167221  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03980  translation initiation factor, putative  30.82 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00811612  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00978  eukaryotic translation initiation factor subunit eIF2B-gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16660)  31.14 
 
 		 582 aa  76.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.903663  normal  0.846946 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10459  translation initiation factor eif-2b epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12530)  21.41 
 
 		 704 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46656  predicted protein  33.33 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81885  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, GEF  21.13 
 
 		 726 aa  60.1  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.541559  normal  0.64637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  20.09 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_969  predicted protein  19.67 
 
 		 693 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  21.04 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.95 
 
 		 842 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  22.27 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.48 
 
 		 842 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 		 835 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  21.8 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  27.91 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  35.38 
 
 		 835 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05090  translation initiation factor eIF-2B epsilon subunit, putative  20.17 
 
 		 757 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46479  translation initiation factor eif-2bgamma  20.25 
 
 		 758 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.99 
 
 		 374 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 397 aa  46.6  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31337  predicted protein  22.15 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  37.93 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  25.77 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  33.7 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1506  carbonic anhydrase  27.01 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  38.55 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53940  Probable mannose-1-phosphate guanyltransferase (GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase)  20.68 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.812674  normal  0.718195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.2 
 
 		 836 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  33.68 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1785  carbonic anhydrase  35.71 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0548346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  25.3 
 
 		 370 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  22.22 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3606  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.72 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  31.91 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.23 
 
 		 784 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.23 
 
 		 784 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 836 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6354  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  33.66 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  32.86 
 
 		 400 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3456  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  37.68 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  36.51 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>