More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57353 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57353  predicted protein  100 
 
 
122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  41.12 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  41.12 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
118 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0316  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0714162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.448669 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04468  40S ribosomal protein S13 (AFU_orthologue; AFUA_4G07640)  36.75 
 
 
119 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.229794  normal  0.149967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  39.81 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3978  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.287475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0345  ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3800  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0251117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  40.57 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  40.57 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0359  30S ribosomal protein S13  40.91 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.16479e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1832  30S ribosomal protein S13  40.91 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000154353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  42.06 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  43.18 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  39.62 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0603  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101509  normal  0.555026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0305  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000481161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3893  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000123367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
118 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4522  30S ribosomal protein S13  43.18 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153849  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  39.62 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0253  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3737  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0221  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224904  unclonable  0.0000000000165465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0216  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000313091  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2927  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0221  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000205657  unclonable  0.0000000000430972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3274  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000858241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  38.53 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  37.74 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2996  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  38.68 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0427  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  39.62 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  40.91 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  41.12 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  41.67 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0180  30S ribosomal protein S13  43.18 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000423158  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04499  30S ribosomal protein S13  37.04 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.662464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  47.67 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  39.45 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  37.74 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  38.89 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  37.96 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  41.12 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0777  30S ribosomal protein S13  37.38 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  38.32 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  38.32 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4148  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000162209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  41.51 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0221  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185697  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0206  30S ribosomal protein S13  42.05 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000458575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0218  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000881294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4034  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000102079  unclonable  0.00000000000266347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  41.12 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  40.19 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1044  30S ribosomal protein S13  37.96 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  39.25 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3926  30S ribosomal protein S13  37.74 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  42.06 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  38.32 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  41.28 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  46.59 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  40.74 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3420  30S ribosomal protein S13  37.04 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610551  normal  0.118326 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  37.96 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  37.96 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  45.45 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  35.85 
 
 
120 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0192  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0170  30S ribosomal protein S13  44.32 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000107267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3315  30S ribosomal protein S13  37.74 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  39.81 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0235  30S ribosomal protein S13  42.05 
 
 
118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000771174  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  42.05 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0443  30S ribosomal protein S13  38.89 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.647246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  42.05 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>