23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48142 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_48142  chitinase 2 precursor  100 
 
 
397 aa  796    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333864  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91537  chitinase  55.92 
 
 
313 aa  333  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68871  chitinase 3 precursor  56.08 
 
 
437 aa  317  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688997  normal  0.0498735 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08241  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92223]  38.02 
 
 
961 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.879175  normal  0.0215178 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11059  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03530)  35.04 
 
 
562 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.979608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.12 
 
 
648 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  28 
 
 
460 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66502  hypothetical protein  60.87 
 
 
217 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.12 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.89 
 
 
1362 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 
551 aa  50.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  32.14 
 
 
613 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67334  cell wall protein  52 
 
 
281 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151848  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  26.94 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  24.15 
 
 
360 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  24.15 
 
 
360 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  24.15 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.85 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  24.15 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  26.39 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.44 
 
 
846 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.78 
 
 
846 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67638  Fasciclin and related adhesion glycoproteins  40.62 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.804506  normal  0.0159998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>