12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42583 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  100 
 
 		 951 aa  1819    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  31.06 
 
 		 1000 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  32.06 
 
 		 1927 aa  160  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  34.78 
 
 		 1962 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  42.99 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  34.33 
 
 		 1689 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  40.48 
 
 		 766 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  43.06 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  37.45 
 
 		 1348 aa  64.3  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  36.11 
 
 		 2094 aa  56.2  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  37.19 
 
 		 624 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  38.07 
 
 		 1556 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>