64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33273 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  100 
 
 
857 aa  1716    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  47.3 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.301419 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  59.62 
 
 
1009 aa  82.8  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 
851 aa  80.5  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  45.45 
 
 
692 aa  75.1  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  52 
 
 
864 aa  67.8  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  44.3 
 
 
650 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  35.64 
 
 
993 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  50 
 
 
579 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  46.58 
 
 
583 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  53.7 
 
 
596 aa  64.3  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  52 
 
 
675 aa  64.3  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  46.03 
 
 
991 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  37.65 
 
 
1211 aa  61.2  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  36.71 
 
 
880 aa  61.2  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  43.08 
 
 
250 aa  60.8  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  47.06 
 
 
1049 aa  61.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.119069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  52 
 
 
1078 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  41.43 
 
 
333 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  44.44 
 
 
737 aa  60.1  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  40 
 
 
519 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  42.59 
 
 
730 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.872321 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  39.24 
 
 
1195 aa  59.3  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  42.59 
 
 
416 aa  58.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  33.33 
 
 
1150 aa  58.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  41.57 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  43.1 
 
 
146 aa  58.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  50 
 
 
421 aa  58.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00973  Regulatory protein brlA (Bristle A protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10069]  52.63 
 
 
432 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10910  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  46 
 
 
913 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401356  normal  0.142996 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  42.11 
 
 
446 aa  55.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  39.66 
 
 
667 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  39.62 
 
 
781 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  42.31 
 
 
359 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  40.38 
 
 
730 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  38.33 
 
 
626 aa  54.3  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  41.67 
 
 
313 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  38.67 
 
 
513 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06060  expressed protein  40 
 
 
477 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  44.64 
 
 
802 aa  51.2  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.10969 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04900  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 
845 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.266265  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  40.3 
 
 
716 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  43.1 
 
 
746 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  39.68 
 
 
865 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  40.74 
 
 
465 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12306 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02855  pH-response transcription factor pacC/RIM101 Precursor [Contains pH-response transcription factor pacC/RIM101 closed form;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 1;pH-response transcription factor pacC/RIM101 open form 2] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00202]  38.3 
 
 
678 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129543  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  30.39 
 
 
1158 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  32.76 
 
 
741 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67626  zinc finger protein  35.94 
 
 
543 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.482303  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 
1089 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32504  transcriptional repressor  42.31 
 
 
258 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0168465 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02748  C2H2 transcription factor (TFIIIA), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05150)  39.34 
 
 
585 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121213  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01254  C2H2 finger domain protein (Gli3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10280)  30.68 
 
 
377 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.33756  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34444  pH-response transcription factor pacC/RIM101-like protein  36.21 
 
 
642 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.456628  normal  0.884424 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01997  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10380)  40.74 
 
 
428 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00290  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 
815 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  37.18 
 
 
306 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  38.89 
 
 
712 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01251  C2H2 transcription factor (Egr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10230)  41.51 
 
 
242 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200479  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  38.46 
 
 
225 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.383997 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  37.1 
 
 
354 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0534008 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04586  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02080)  36.51 
 
 
226 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.466222  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  37.5 
 
 
627 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65910  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  33.33 
 
 
491 aa  44.3  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>