118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30564 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30564  predicted protein  100 
 
 		 205 aa  420  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05410  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 		 382 aa  72  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152877  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09464  Glutaredoxin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09090)  46.91 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  40.91 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_006686  CND01340  glutathione transferase, putative  41.25 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37445  predicted protein  42.67 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.16 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43497  glutaredoxin  40.95 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00275493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  35.87 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  37.36 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16854  glutaredoxin  37.78 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  32.61 
 
 		 83 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  32.97 
 
 		 85 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 84 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.97 
 
 		 85 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  31.52 
 
 		 84 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  35.56 
 
 		 86 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  37.36 
 
 		 85 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3856  glutaredoxin 3  36.26 
 
 		 85 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  31.52 
 
 		 84 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  31.52 
 
 		 84 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  32.61 
 
 		 83 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 85 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.87 
 
 		 85 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3516  glutaredoxin 3  35.29 
 
 		 80 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0715  glutaredoxin 3  35.63 
 
 		 91 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  35.87 
 
 		 83 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  34.07 
 
 		 102 aa  51.6  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  38.37 
 
 		 95 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 81 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  30.11 
 
 		 89 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32.29 
 
 		 84 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4101  glutaredoxin 3  34.12 
 
 		 86 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  29.67 
 
 		 84 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  35.16 
 
 		 84 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  35.56 
 
 		 84 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  31.25 
 
 		 84 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0929  glutaredoxin 3  33.72 
 
 		 87 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.97 
 
 		 85 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0127  glutaredoxin GrxC  38.14 
 
 		 91 aa  48.5  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0333761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  32.95 
 
 		 89 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  33.72 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  36.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  34.07 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  33.72 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  32.18 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  34.07 
 
 		 87 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0612  glutaredoxin GrxC  33.71 
 
 		 86 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 88 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  31.87 
 
 		 84 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  33.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  29.67 
 
 		 84 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  32.22 
 
 		 84 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  38.04 
 
 		 87 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  33.72 
 
 		 88 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1815  glutaredoxin 3  30.59 
 
 		 85 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  31.82 
 
 		 84 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  35.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 83 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 83 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 83 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 83 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 83 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  32.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  31.03 
 
 		 81 aa  44.3  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  32.22 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  32.58 
 
 		 88 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  32.95 
 
 		 84 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  34.12 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  35.23 
 
 		 101 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  34.44 
 
 		 87 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  32.18 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  32.22 
 
 		 91 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  27.17 
 
 		 86 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  27.91 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  30.83 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  30.83 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  30.83 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  34.07 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  35.23 
 
 		 101 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>