63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46728 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.33 
 
 		 153 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  61.59 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  62 
 
 		 158 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  58.97 
 
 		 169 aa  200  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  59.74 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  59.33 
 
 		 163 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.58 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  60 
 
 		 153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  60 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  59.73 
 
 		 162 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  62 
 
 		 154 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  60 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  58.67 
 
 		 155 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  56.49 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  58.28 
 
 		 155 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.33 
 
 		 155 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  32.19 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  28.37 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  35.87 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  28.35 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.99 
 
 		 131 aa  52  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  26.75 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  24.14 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  38.46 
 
 		 135 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  29.27 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  31.78 
 
 		 156 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  31.78 
 
 		 156 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  23.19 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.64 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.48 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  30.84 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  26.76 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  28.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  23.94 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  23.74 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  27.66 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  29.08 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  38.1 
 
 		 134 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 133 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  26.61 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.71 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.57641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  24.66 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  31.36 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  28.04 
 
 		 132 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  24.11 
 
 		 134 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  24.11 
 
 		 157 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  29.09 
 
 		 129 aa  41.6  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.31 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  31.46 
 
 		 140 aa  41.2  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>