30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6300 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  100 
 
 
195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  40.72 
 
 
1004 aa  156  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  37.86 
 
 
501 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  45 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  43.36 
 
 
349 aa  124  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  36.13 
 
 
567 aa  122  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  34.54 
 
 
1256 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  36.16 
 
 
200 aa  118  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  38.73 
 
 
594 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  34.76 
 
 
425 aa  109  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  37.84 
 
 
427 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  35.86 
 
 
499 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  33.69 
 
 
349 aa  101  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  27.93 
 
 
588 aa  99.8  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  38.3 
 
 
168 aa  98.6  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  30.98 
 
 
1341 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  29.49 
 
 
335 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  39.02 
 
 
548 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  28.09 
 
 
485 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  31.95 
 
 
165 aa  88.6  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  33.12 
 
 
1416 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  31.39 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  34.03 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  24.06 
 
 
921 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  24.86 
 
 
977 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  28.14 
 
 
871 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49745  predicted protein  28.39 
 
 
576 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43595  predicted protein  28.28 
 
 
469 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46449  predicted protein  30.22 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202734  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  32.5 
 
 
951 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>