21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50457 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_50457  predicted protein  100 
 
 		 1065 aa  2191    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0351497  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45222  predicted protein  55.56 
 
 		 1276 aa  453  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0393283  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45221  predicted protein  53.45 
 
 		 1064 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39605  predicted protein  36.34 
 
 		 1062 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608294  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44310  predicted protein  36.34 
 
 		 974 aa  238  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45225  predicted protein  38.6 
 
 		 1137 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07571  mechanosensitive ion channel, putative (Eurofung)  19.17 
 
 		 944 aa  62  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.659359  normal  0.533203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  34.65 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02120  conserved hypothetical protein  20.33 
 
 		 895 aa  57.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  27.33 
 
 		 271 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  27.33 
 
 		 271 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 341 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  24.4 
 
 		 283 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 		 393 aa  48.5  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1199  mechanosensitive ion channel component  26.62 
 
 		 281 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000786613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 297 aa  46.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 275 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 276 aa  46.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3375  MscS mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 302 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 277 aa  45.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  24.58 
 
 		 380 aa  44.7  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>