13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49209 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49209  predicted protein  100 
 
 
526 aa  1087    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0370698  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46378  predicted protein  40 
 
 
509 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  40 
 
 
467 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48753  predicted protein  32.64 
 
 
1110 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46563  predicted protein  29.53 
 
 
1245 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629816  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46560  predicted protein  29.53 
 
 
1245 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.585047  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46559  predicted protein  33.33 
 
 
1009 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1270  hypothetical protein  27.64 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16390  hypothetical protein  30.29 
 
 
188 aa  50.1  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.244545 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  38.04 
 
 
840 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  40.51 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  44.78 
 
 
1217 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.43 
 
 
690 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>