23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45737 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  100 
 
 
882 aa  1808    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  47.1 
 
 
859 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1839  signal peptide and transmembrane prediction  45.48 
 
 
648 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107025  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35518  predicted protein  36.75 
 
 
982 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2986  hypothetical protein  35.34 
 
 
1042 aa  343  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.587543  hitchhiker  0.000328281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  36.34 
 
 
823 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45740  predicted protein  34.12 
 
 
825 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  32.68 
 
 
1656 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  36.64 
 
 
295 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  32.5 
 
 
872 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  31.71 
 
 
1342 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  35.54 
 
 
1216 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2946  hypothetical protein  23.96 
 
 
570 aa  51.6  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  35.64 
 
 
1096 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.65 
 
 
840 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  41.1 
 
 
1217 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  39.73 
 
 
551 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  35.29 
 
 
504 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  33.68 
 
 
259 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  36.08 
 
 
555 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2277  hypothetical protein  34.04 
 
 
536 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
846 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3918  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.91 
 
 
901 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>