27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45072 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45072  predicted protein  100 
 
 		 947 aa  1969    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  47.68 
 
 		 2017 aa  490  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06076  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09120)  35.73 
 
 		 2379 aa  324  5e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  38.29 
 
 		 1856 aa  232  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 		 385 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  28.95 
 
 		 440 aa  54.3  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.74 
 
 		 320 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  23.66 
 
 		 492 aa  51.2  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 460 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 460 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 368 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  25 
 
 		 437 aa  47.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  27.52 
 
 		 407 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.04 
 
 		 387 aa  46.6  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.22 
 
 		 328 aa  46.6  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.32 
 
 		 424 aa  47  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  24.8 
 
 		 415 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  23.66 
 
 		 438 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  22.5 
 
 		 427 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 		 350 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  23.08 
 
 		 390 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  26.72 
 
 		 423 aa  45.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 		 467 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  21.4 
 
 		 315 aa  44.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  23.53 
 
 		 404 aa  44.3  0.01  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  29.36 
 
 		 387 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>