42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37658 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37658  predicted protein  100 
 
 
225 aa  472  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275908  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35431  predicted protein  43.46 
 
 
221 aa  184  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.501778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0116  Glutathione S-transferase domain protein  33.48 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0628557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3267  glutathione S-transferase-like  30.7 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0385  glutathione S-transferase-like protein  29.46 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  27.08 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  28.33 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  25.51 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6097  Glutathione S-transferase domain protein  35.34 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0287375  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  27.23 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  25.27 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.7 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  27.18 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  24.49 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  24.49 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  24.73 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  24.49 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  25.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  24.49 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  24.49 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  22.53 
 
 
204 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  26.9 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  24.37 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  23.61 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  22.27 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  21.43 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  25.26 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27489  predicted protein  32.43 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27416  predicted protein  32.43 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.79 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  24.12 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  24.12 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  20.57 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  25.13 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0332  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.16 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  32.91 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.43 
 
 
216 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  24.52 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  24.55 
 
 
221 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.68 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  23.91 
 
 
223 aa  41.6  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  22.94 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>