28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3238 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2880  YcfA family protein  92.75 
 
 		 69 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0224984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1634  hypothetical protein  37.7 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  33.33 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  42.86 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1587  hypothetical protein  38.71 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1999  hypothetical protein  38.33 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00856081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2943  YcfA family protein  36.36 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3153  YcfA family protein  36.36 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3798  YcfA family protein  37.5 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2546  YcfA family protein  39.06 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2021  YcfA-like  35.09 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  31.88 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1010  hypothetical protein  34.85 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000868639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  36.36 
 
 		 74 aa  43.9  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2354  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.104234  normal  0.0102619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  36.84 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  37.5 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  35.59 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  40.54 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1077  YcfA-like protein  34.55 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615888  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  30.16 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0801  YcfA family protein  26.23 
 
 		 65 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.156582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2644  YcfA family protein  28.33 
 
 		 67 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>