36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0917 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  99.05 
 
 		 529 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  100 
 
 		 529 aa  1068    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  50.91 
 
 		 547 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 1007 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  32.54 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 795 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 795 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  32.57 
 
 		 813 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 		 791 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 758 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 780 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 981 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  22.5 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.77 
 
 		 370 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  34.21 
 
 		 416 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 378 aa  53.9  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  22.34 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  21.99 
 
 		 373 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.85 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 384 aa  50.8  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 		 371 aa  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 576 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.46 
 
 		 371 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19650  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid binding protein  22.5 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 		 380 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  21.8 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.08 
 
 		 371 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.02 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 401 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.5 
 
 		 863 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.76 
 
 		 399 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>