51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2399 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  51.69 
 
 
304 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  28.45 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  37.39 
 
 
833 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  49.25 
 
 
644 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 
480 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
718 aa  53.9  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  26.2 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  40.3 
 
 
625 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  40.3 
 
 
625 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  31.13 
 
 
686 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  36.19 
 
 
605 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  24.06 
 
 
444 aa  49.7  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  33.33 
 
 
652 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  34.43 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  31.91 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  32.77 
 
 
642 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  37.76 
 
 
1327 aa  48.9  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  23.08 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  36.25 
 
 
352 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.32 
 
 
420 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  23.93 
 
 
952 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  49.09 
 
 
877 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  39.39 
 
 
603 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
486 aa  46.6  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  25 
 
 
756 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  31.93 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.65 
 
 
646 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  34.09 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  25.69 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  38.1 
 
 
660 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  34.09 
 
 
540 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  32.29 
 
 
179 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  34.09 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  31.93 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  34.09 
 
 
563 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  34.09 
 
 
563 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  34.09 
 
 
563 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  34.09 
 
 
563 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  25.69 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  33.87 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  37.93 
 
 
921 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  31.73 
 
 
487 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  41.27 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
1118 aa  42.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  25.17 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  30.67 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>