191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3236 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  86.49 
 
 		 259 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  90.32 
 
 		 255 aa  457  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  83.27 
 
 		 255 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  85.34 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  71.43 
 
 		 259 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  68.55 
 
 		 255 aa  359  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  63.27 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  48.75 
 
 		 268 aa  234  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1214  Ankyrin  27.69 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1215  Ankyrin  29.96 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3036  Ankyrin  25.1 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  28.64 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  27.2 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  25.45 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2436  Ankyrin  26.91 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.274512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3680  ankyrin  26.77 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0048166  normal  0.286035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  29.63 
 
 		 954 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1585 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  26 
 
 		 1005 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  30.77 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  30.07 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  28.48 
 
 		 762 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  30.94 
 
 		 790 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0818  hypothetical protein  24.07 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493541 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  28.8 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.99 
 
 		 870 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  28.66 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  36.45 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1519  Ankyrin  25.56 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0819  Ankyrin  22.9 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00484639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  29.01 
 
 		 1061 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 1622 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  26.47 
 
 		 715 aa  62.4  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  23.49 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 1021 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  24.53 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  28 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2122 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  26.06 
 
 		 1156 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 1977 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  27.22 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  28.99 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  25.68 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  24.83 
 
 		 723 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43280  predicted protein  27.49 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.390261  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  28.65 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  28.86 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  25.87 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00214  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574203  normal  0.267859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  30.07 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  25.15 
 
 		 2171 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  29.92 
 
 		 161 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  28.77 
 
 		 545 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  28.31 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  27.45 
 
 		 750 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  30.6 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  24.17 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0934  ankyrin  28.8 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.793859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  30.65 
 
 		 469 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  28.66 
 
 		 395 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  27.15 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  26.54 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  30.17 
 
 		 648 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  26.04 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  32.71 
 
 		 157 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  27.71 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  27.11 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  24.86 
 
 		 358 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.39 
 
 		 731 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  26.67 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  28.29 
 
 		 321 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  26.03 
 
 		 4520 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1125  ankyrin repeat-containing protein  24.16 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  27.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  27.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  31.07 
 
 		 544 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  33.71 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  22.71 
 
 		 382 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  29.82 
 
 		 821 aa  52.4  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3599  ankyrin repeat-containing protein  24.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  28.15 
 
 		 157 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1177  ankyrin  24.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  27.71 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  25.9 
 
 		 171 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 1133 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  24.85 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  27.7 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  24.84 
 
 		 472 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  25.41 
 
 		 756 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  22.75 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  28.48 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  27.54 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  31.3 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  26.87 
 
 		 933 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  29.91 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  30.09 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  20 
 
 		 2413 aa  50.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2701  Ankyrin  26.49 
 
 		 385 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.575669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>