66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0818 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0818  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0819  Ankyrin  67.09 
 
 
269 aa  339  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00484639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  26.02 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  24.07 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  24.07 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  25 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  26.6 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  28.33 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  29.79 
 
 
395 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  26.47 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  26.92 
 
 
395 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  26.51 
 
 
490 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  24.18 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  29.88 
 
 
750 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  26.13 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  30.56 
 
 
1156 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  26.29 
 
 
1585 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  28.28 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  25.49 
 
 
494 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  25.27 
 
 
450 aa  52  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  25.7 
 
 
756 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  25.81 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  25.15 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  24.4 
 
 
740 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  26.92 
 
 
762 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  25.46 
 
 
382 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  27.47 
 
 
426 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.06 
 
 
427 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  24.42 
 
 
1005 aa  48.5  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2373  Ankyrin  26.01 
 
 
555 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000336897  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  26.26 
 
 
790 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  25.25 
 
 
404 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  30.56 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  26.96 
 
 
821 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  27.65 
 
 
870 aa  47  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  28.48 
 
 
723 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  25.47 
 
 
640 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  29.61 
 
 
483 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2101  TonB-like protein  27.78 
 
 
487 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  28.46 
 
 
731 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  30.56 
 
 
156 aa  45.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  24.26 
 
 
1061 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  30.56 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1133 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  26.09 
 
 
197 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  35.16 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  25.37 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.17 
 
 
483 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  41.51 
 
 
715 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  26.38 
 
 
891 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  25.43 
 
 
445 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  33.9 
 
 
344 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  27.43 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  33.33 
 
 
1003 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  29.35 
 
 
173 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  28.67 
 
 
161 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  27.01 
 
 
1307 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 
428 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2058  hypothetical protein  24.16 
 
 
951 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  23.93 
 
 
2413 aa  42.7  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  27.13 
 
 
4520 aa  42.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  24.55 
 
 
2171 aa  42.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  21.89 
 
 
954 aa  42.4  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  25.14 
 
 
931 aa  42  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  23.66 
 
 
404 aa  42  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>