42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0819 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0819  Ankyrin  100 
 
 
269 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00484639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0818  hypothetical protein  67.09 
 
 
237 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000493541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  32.68 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  26.72 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2436  Ankyrin  31.61 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.274512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  27.08 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  24.3 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  22.9 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  25.26 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  23.56 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  27.46 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  24.49 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.65 
 
 
427 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  23.08 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  25.31 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  27.46 
 
 
490 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  29.13 
 
 
216 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  25.66 
 
 
1585 aa  49.3  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  25.17 
 
 
494 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.14 
 
 
382 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  28.67 
 
 
756 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  24.81 
 
 
1005 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  27.01 
 
 
790 aa  47.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  26.67 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  24.34 
 
 
740 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  27.78 
 
 
762 aa  46.6  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  28.57 
 
 
581 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  30.99 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  30.99 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 
1133 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  30.99 
 
 
156 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7558  hypothetical protein  29.41 
 
 
336 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0501951  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  25.69 
 
 
723 aa  43.5  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  28.08 
 
 
426 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  32.47 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  30.23 
 
 
4520 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  28.85 
 
 
1061 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  34.57 
 
 
1003 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  26.9 
 
 
870 aa  42.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  29.3 
 
 
395 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  24.49 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  31.65 
 
 
237 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>