27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_60140  xerD-like putative integrase  100 
 
 		 306 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287702  hitchhiker  0.00000000219898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  98.06 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  97.29 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  72.09 
 
 		 449 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  68.22 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  57.75 
 
 		 468 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  38.93 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  33.71 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  33.46 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  33.58 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  30.23 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  30.62 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  29.86 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.77 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.17 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  25.26 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  23.28 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  35.59 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  23.68 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  25.15 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  22.07 
 
 		 431 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.62 
 
 		 426 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  21.62 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  27.18 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.86 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>