42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46760 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  249  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  91.01 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  58.43 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  57.78 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  55.06 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  55.06 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  56.18 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  57.3 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  56.18 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  56.18 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  48.31 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  51.69 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  46.07 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  50.56 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  35.96 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  35.63 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 		 364 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  40.3 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  35.71 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  32.97 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  30.77 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  36.76 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  30.56 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  28.41 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  30.56 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  33.8 
 
 		 643 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  39.73 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  28.79 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  35.06 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  30.85 
 
 		 94 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  30.56 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  36.76 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  27.91 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  27.78 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  30.43 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  37.88 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>