31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  54.28 
 
 
370 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  54.9 
 
 
325 aa  364  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  35.69 
 
 
336 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  34.21 
 
 
347 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  37.05 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  35.35 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  35.71 
 
 
798 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  32.36 
 
 
318 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  31.46 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  31.48 
 
 
345 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  27.51 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  36.11 
 
 
151 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  38.4 
 
 
166 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  27.27 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  24.41 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.64 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.82 
 
 
473 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  28.31 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2034  hypothetical protein  36.92 
 
 
92 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  26.29 
 
 
476 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  26.24 
 
 
406 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  41.1 
 
 
490 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  34.94 
 
 
478 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  30.4 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  25.95 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  25.35 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  29.85 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  30.53 
 
 
476 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  26.53 
 
 
470 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  26.61 
 
 
491 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>