More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_rrsVIMSS1309438 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_rrsVIMSS1309404  16S ribosomal RNA  98.5 
 
 		 1465 bp  2730    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.712316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0043  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1474 bp  1647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000929778  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0042  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 		 1479 bp  1433    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00382367  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0024  16S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 1479 bp  1441    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0006  16S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 1474 bp  1647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0025  16S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 1477 bp  1451    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0178526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0029  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 		 1479 bp  1285    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0023  16S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 1479 bp  1441    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382487  normal  0.0885357 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0036  16S ribosomal RNA  98.35 
 
 		 1394 bp  2581    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0006  16S ribosomal RNA  88.63 
 
 		 1488 bp  1524    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0630804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0024  16S ribosomal RNA  88.63 
 
 		 1490 bp  1524    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000346513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0035  16S ribosomal RNA  88.63 
 
 		 1488 bp  1524    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0053  16S ribosomal RNA  88.63 
 
 		 1490 bp  1524    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0046  16S ribosomal RNA  97.54 
 
 		 1479 bp  2613    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.76597  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0051  16S ribosomal RNA  97.53 
 
 		 1458 bp  2597    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0016  16S ribosomal RNA  97.36 
 
 		 1440 bp  2545    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0817625  normal  0.696082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0051  16S ribosomal RNA  97.36 
 
 		 1440 bp  2545    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0008  16S ribosomal RNA  87.87 
 
 		 1478 bp  1445    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0215211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0016  16S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 1477 bp  1451    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000540831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0038  16S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 1477 bp  1451    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.319157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0041  16S ribosomal RNA  87.93 
 
 		 1479 bp  1441    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  98.36 
 
 		 1498 bp  2714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0011  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1479 bp  1277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  98.29 
 
 		 1465 bp  2706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 1490 bp  1784    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  90.74 
 
 		 1490 bp  1784    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrsVIMSS1309438  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1465 bp  2904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.227011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0038  16S ribosomal RNA  86.14 
 
 		 1479 bp  1277    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0014  16S ribosomal RNA  87.53 
 
 		 1482 bp  1404    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000301057  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0029  16S ribosomal RNA  87.53 
 
 		 1482 bp  1404    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00282638  decreased coverage  0.00054709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  98.23 
 
 		 1465 bp  2698    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  98.43 
 
 		 1465 bp  2722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309420  16S ribosomal RNA  98.07 
 
 		 1401 bp  2563    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrsVIMSS1309419  16S ribosomal RNA  98.07 
 
 		 1401 bp  2563    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0003  16S ribosomal RNA  84.84 
 
 		 1587 bp  615  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0081  16S ribosomal RNA  84.84 
 
 		 1587 bp  615  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0009  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1587 bp  607  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000146343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0022  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1587 bp  607  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0064  16S ribosomal RNA  84.72 
 
 		 1587 bp  607  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000848951  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0046  16S ribosomal RNA  84.61 
 
 		 1587 bp  599  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000560958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0012  16S ribosomal RNA  84.23 
 
 		 1555 bp  589  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000489495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0058  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0041  16S ribosomal RNA  83.98 
 
 		 1521 bp  563  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0001  16S ribosomal RNA  83.9 
 
 		 1612 bp  561  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.764538  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0011  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 		 1556 bp  557  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  81.81 
 
 		 1501 bp  557  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  81.81 
 
 		 1501 bp  557  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  81.81 
 
 		 1501 bp  557  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0094  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1612 bp  553  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.209006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0031  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1612 bp  553  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000490683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0054  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1521 bp  555  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0158667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0014  16S ribosomal RNA  83.79 
 
 		 1612 bp  553  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0066  16S ribosomal RNA  83.87 
 
 		 1521 bp  555  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna52  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1535 bp  551  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna59  16S ribosomal RNA  84.73 
 
 		 1535 bp  551  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000514214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0015  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000381882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0027  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0030  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0716332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0065  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0071  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0146  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000258872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.5 
 
 		 1526 bp  547  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0054  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000307984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0059  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0062  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0074  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0190037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0068  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0001  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0008  16S ribosomal RNA  83.6 
 
 		 1545 bp  547  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.331596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0047  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.550323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0050  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0061  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000932008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0078  16S ribosomal RNA  83.68 
 
 		 1612 bp  545  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0094  16S ribosomal RNA  83.49 
 
 		 1545 bp  539  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000260573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_r01  16S ribosomal RNA  83.52 
 
 		 1555 bp  533  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0018  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1554 bp  525  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000694535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0061  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1554 bp  525  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5771  16S ribosomal RNA  83.41 
 
 		 1562 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000116476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  83.2 
 
 		 1528 bp  525  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 		 1546 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0142  16S ribosomal RNA  83.54 
 
 		 1544 bp  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000978777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  82.13 
 
 		 1546 bp  519  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  82.21 
 
 		 1546 bp  521  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5671  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1509 bp  517  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000020932 
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-1  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-16s-4  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.823998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0302  16S ribosomal RNA  83.2 
 
 		 1509 bp  513  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000398573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_13  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_2  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_3  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_4  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-16SrRNA_6  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_12  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.379759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  82.11 
 
 		 1546 bp  513  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_7  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.153942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_8  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-16SrRNA_9  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1510 bp  515  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1585  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1579 bp  513  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  82.05 
 
 		 1546 bp  515  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0449  16S ribosomal RNA  83.28 
 
 		 1579 bp  513  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.3791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>