12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4485 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1199  hypothetical protein  82.76 
 
 		 898 aa  1554    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4485  hypothetical protein  100 
 
 		 897 aa  1857    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  31.87 
 
 		 874 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  28.8 
 
 		 847 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  25.38 
 
 		 864 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  31.33 
 
 		 875 aa  52  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.07 
 
 		 608 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.7 
 
 		 868 aa  46.2  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.84 
 
 		 866 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  23.08 
 
 		 611 aa  45.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.16 
 
 		 631 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  25.19 
 
 		 864 aa  44.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>