15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1461 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1436    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  26.35 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  27.95 
 
 		 657 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  27.17 
 
 		 631 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  26.43 
 
 		 618 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  27.35 
 
 		 620 aa  162  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  25.86 
 
 		 620 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  25.82 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  22.16 
 
 		 790 aa  127  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  23.46 
 
 		 949 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1344 aa  50.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  24.26 
 
 		 1432 aa  49.7  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  23.46 
 
 		 1532 aa  48.5  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  24.66 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  25.14 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>