More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1045 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  100 
 
 
658 aa  1354    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  52.77 
 
 
686 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  52.64 
 
 
700 aa  749    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  53.51 
 
 
688 aa  708    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  45.74 
 
 
626 aa  598  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40885  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.72 
 
 
713 aa  280  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33475  predicted protein  31.82 
 
 
699 aa  262  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0672097  normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45509  predicted protein  30.06 
 
 
723 aa  247  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.25219  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02550  NAD+ synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.25 
 
 
652 aa  233  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08203  glutamine dependent NAD synthetase (Eurofung)  28.47 
 
 
678 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0452691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  29.14 
 
 
652 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.31 
 
 
566 aa  187  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.39 
 
 
566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  24.96 
 
 
642 aa  184  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  28.12 
 
 
576 aa  183  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.04 
 
 
567 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  28.01 
 
 
576 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  25.79 
 
 
635 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  27.14 
 
 
587 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.08 
 
 
566 aa  180  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  26.05 
 
 
577 aa  180  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  25.79 
 
 
635 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  26.89 
 
 
647 aa  178  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.05 
 
 
577 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.02 
 
 
545 aa  177  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  26.32 
 
 
538 aa  177  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  25.95 
 
 
583 aa  176  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  26.36 
 
 
647 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  26.52 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
564 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  25.74 
 
 
645 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  23.5 
 
 
573 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  27.86 
 
 
599 aa  169  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  26.84 
 
 
556 aa  167  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  24.92 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  28.77 
 
 
558 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  26.32 
 
 
539 aa  164  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.61 
 
 
575 aa  164  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  26.59 
 
 
644 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  28.11 
 
 
571 aa  163  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.64 
 
 
574 aa  163  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  26.78 
 
 
582 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  27.18 
 
 
690 aa  160  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.19 
 
 
577 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  26.69 
 
 
566 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  25.95 
 
 
546 aa  160  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  27 
 
 
562 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  24.53 
 
 
558 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  26.88 
 
 
690 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  27.68 
 
 
583 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.41 
 
 
543 aa  158  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  26.83 
 
 
547 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  27.27 
 
 
573 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  25.23 
 
 
538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  26.48 
 
 
545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  26.48 
 
 
545 aa  157  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  24.73 
 
 
542 aa  157  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  27.03 
 
 
690 aa  157  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  27.04 
 
 
569 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  24.76 
 
 
554 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  28.15 
 
 
552 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  24.73 
 
 
542 aa  156  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25.6 
 
 
561 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.52 
 
 
577 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  26.03 
 
 
544 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  26.17 
 
 
566 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  27.66 
 
 
590 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.61 
 
 
567 aa  154  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  26.57 
 
 
539 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.96 
 
 
567 aa  154  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  26.59 
 
 
559 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  27.19 
 
 
564 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  25.12 
 
 
545 aa  154  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  26.6 
 
 
571 aa  154  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  26.01 
 
 
552 aa  154  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  25.82 
 
 
574 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  24.96 
 
 
554 aa  153  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  25.45 
 
 
561 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  28.66 
 
 
538 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  26.34 
 
 
550 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2333  NAD synthetase  28.4 
 
 
554 aa  151  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  26.03 
 
 
539 aa  151  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  27.68 
 
 
561 aa  151  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.99 
 
 
561 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  25.46 
 
 
683 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.29 
 
 
552 aa  150  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  26.28 
 
 
689 aa  150  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  26.75 
 
 
583 aa  150  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.04 
 
 
569 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  25 
 
 
552 aa  150  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
577 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  24.73 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  27.04 
 
 
569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  24.25 
 
 
561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  26.5 
 
 
566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  25.78 
 
 
685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  26.33 
 
 
550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  26.6 
 
 
686 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  27.31 
 
 
546 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  24.25 
 
 
561 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>