26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1037 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  100 
 
 		 388 aa  805    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  30.71 
 
 		 382 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  28.48 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  28.41 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  30.46 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  30.46 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  30.46 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  30.46 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  30.46 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  28.98 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  27.97 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  27.97 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  29.07 
 
 		 344 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  25.33 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  27.71 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  30.73 
 
 		 242 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  26.2 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  24.79 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  24.91 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  22.76 
 
 		 356 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  22.76 
 
 		 356 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25.81 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.63 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.63 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.63 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.63 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>