38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0980 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 445 aa  898    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  36.82 
 
 		 288 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  31.54 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  32.95 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  30.63 
 
 		 277 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  31.08 
 
 		 308 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  33.21 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30 
 
 		 273 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  25.86 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  27.34 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  25.82 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  26.29 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  25.82 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.88 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  24.4 
 
 		 642 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2661  hypothetical protein  29.49 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.380433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3498  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.22 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.87 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.06 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  29.23 
 
 		 906 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.35 
 
 		 913 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.44 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.44 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  20.9 
 
 		 330 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  29.25 
 
 		 220 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.03 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.13 
 
 		 888 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  28.25 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  23.97 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  30.09 
 
 		 363 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  22.08 
 
 		 930 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  24.3 
 
 		 331 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  39.29 
 
 		 543 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1667 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  29.45 
 
 		 244 aa  43.5  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.99 
 
 		 526 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  25.63 
 
 		 304 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>