More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0233 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
129 aa  236  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  70.59 
 
 
124 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  69.75 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 
125 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 
128 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 
125 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  74.17 
 
 
125 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
127 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
127 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  71.07 
 
 
126 aa  123  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  71.07 
 
 
125 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  73.55 
 
 
125 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
127 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
127 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  71.67 
 
 
124 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
121 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
126 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
127 aa  120  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 
125 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
124 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  73.55 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  71.07 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  117  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
123 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
124 aa  117  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
126 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  70.49 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 
123 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  72.5 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  72.5 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  114  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  67.77 
 
 
123 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
125 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
121 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
129 aa  114  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  67.5 
 
 
124 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
126 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  67.5 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
126 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
124 aa  110  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
124 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  67.5 
 
 
123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  67.23 
 
 
127 aa  107  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
128 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  61.42 
 
 
128 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
123 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>