More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32559 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32559  Plastid ribosomal protein L27 large ribosomal subunit  100 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0311602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35728  predicted protein  87.83 
 
 		 121 aa  203  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 82 aa  101  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 92 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 92 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  99  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 93 aa  97.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  97.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  97.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 84 aa  97.4  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  97.1  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 84 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  60.98 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  69.57 
 
 		 85 aa  96.3  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  67.14 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0436  50S ribosomal protein L27  60.76 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  60 
 
 		 83 aa  96.3  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 92 aa  95.5  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 85 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 87 aa  95.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 91 aa  94.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 85 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 89 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 85 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 91 aa  94.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 84 aa  94  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0342  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  94  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  8.5444e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 86 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 89 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  65.71 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  63.77 
 
 		 87 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 89 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>