51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0070 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  90.41 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  87.18 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  87.18 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  87.18 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  90 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0057  tRNA-His  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0002  tRNA-His  86.3 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  86.3 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0069  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-His-1  tRNA-His  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0015  tRNA-His  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.956741  normal  0.235739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0802458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0078  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  85.14 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0040  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.651238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0004  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.817868  normal  0.0325973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0063  tRNA-His  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4336  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0047  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.030582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>