19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4732 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4732  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1538  hypothetical protein  37.71 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1739  putative ATP/GTP-binding protein  30.32 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0339403  normal  0.147783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8601  putative ATP/GTP-binding protein  27.75 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193536  normal  0.420749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1784  hypothetical protein  29.68 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2597  putative atp/GTP-binding protein  29.41 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1477  hypothetical protein  27.6 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0113497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2765  histone methyltransferase  27.69 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00603093  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0845  hypothetical protein  27.01 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.289491  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0668  putative ATP/GTP-binding protein  27 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4028  hypothetical protein  27.91 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0147836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0115035  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1220  hypothetical protein  29.69 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.909283  decreased coverage  0.00438617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2232  putative atp/GTP-binding protein  28.7 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3428  hypothetical protein  25.11 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1644  hypothetical protein  26.02 
 
 		 354 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163847  decreased coverage  0.000136563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1357  hypothetical protein  28.05 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>