More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4569 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
479 aa  972    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  60.37 
 
 
500 aa  586  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  61.25 
 
 
494 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  63.33 
 
 
494 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  56.13 
 
 
489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  55.51 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  57.71 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  56.13 
 
 
489 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  54.68 
 
 
491 aa  569  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  55.51 
 
 
494 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  54.79 
 
 
527 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  55.09 
 
 
491 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  57.44 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  57.08 
 
 
505 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  57.44 
 
 
503 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  55.08 
 
 
498 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  54.28 
 
 
493 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  56.39 
 
 
509 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  57.08 
 
 
477 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  53.75 
 
 
500 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  57.76 
 
 
489 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 
516 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  54.43 
 
 
520 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  53.93 
 
 
486 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  54.77 
 
 
532 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  54.77 
 
 
532 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  54.77 
 
 
532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  53.53 
 
 
508 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
520 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  54.77 
 
 
532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  54.77 
 
 
532 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  54.56 
 
 
532 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  54.36 
 
 
532 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  53.11 
 
 
500 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  53.83 
 
 
524 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  53.85 
 
 
516 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  53.72 
 
 
520 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  53.72 
 
 
530 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  53.96 
 
 
532 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  53.31 
 
 
530 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  53.31 
 
 
530 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  52.7 
 
 
499 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  53.42 
 
 
508 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  53.94 
 
 
495 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  53.01 
 
 
497 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
485 aa  514  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  53.11 
 
 
499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  53.47 
 
 
522 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  55.23 
 
 
498 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  50.94 
 
 
508 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  51.46 
 
 
508 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  52.8 
 
 
509 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  51.75 
 
 
495 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  51.14 
 
 
506 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  50 
 
 
494 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 
493 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  53.72 
 
 
504 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  51.78 
 
 
510 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  50.64 
 
 
499 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  49.47 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  48.97 
 
 
509 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  49.58 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  49.06 
 
 
507 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  46.54 
 
 
491 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  46.99 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  48.77 
 
 
513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 
509 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 
503 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  47.75 
 
 
496 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  44.83 
 
 
540 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  47.13 
 
 
484 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  46.44 
 
 
544 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  48.16 
 
 
514 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  44.17 
 
 
510 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  45.65 
 
 
502 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  47.34 
 
 
508 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  44.67 
 
 
500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  44.35 
 
 
503 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  44.64 
 
 
505 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  42.5 
 
 
514 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  53.7 
 
 
224 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.84 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.97 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  26.47 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
662 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0586  putative flavin-binding monooxygenase  29.22 
 
 
514 aa  137  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643741  normal  0.361542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
642 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
642 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  35.21 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  30 
 
 
489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  28.86 
 
 
508 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  27.63 
 
 
570 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  28.72 
 
 
514 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
556 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2620  cyclohexanone monooxygenase  27.86 
 
 
517 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581774  normal  0.881203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  28.01 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>