26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3028 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  263  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  40.66 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  46.39 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  37.38 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.71 
 
 		 438 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  41.18 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  30.36 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  31.75 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1253  hypothetical protein  43.64 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  38.89 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  35.63 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  35.06 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  40.54 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  32.14 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  39.51 
 
 		 249 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  36.59 
 
 		 484 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  44.26 
 
 		 160 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00478481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  30.77 
 
 		 163 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  33.71 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5118  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1008 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.52271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  34.18 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>