More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2044 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  67.35 
 
 
680 aa  947    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  65.35 
 
 
679 aa  882    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  53.05 
 
 
704 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  75.18 
 
 
686 aa  1004    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  66.81 
 
 
680 aa  932    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  54.85 
 
 
682 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  67.89 
 
 
680 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  55.21 
 
 
691 aa  736    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  52.13 
 
 
714 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  66.62 
 
 
679 aa  917    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  68.23 
 
 
738 aa  944    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  61.82 
 
 
699 aa  819    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  51.01 
 
 
802 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  62.85 
 
 
690 aa  841    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  64.26 
 
 
678 aa  862    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  63.38 
 
 
690 aa  841    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  57.08 
 
 
692 aa  768    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  61.14 
 
 
684 aa  837    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  57.81 
 
 
686 aa  783    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  60.59 
 
 
687 aa  808    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  53.85 
 
 
716 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  53.43 
 
 
685 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  67.35 
 
 
680 aa  947    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  62.19 
 
 
681 aa  815    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  53.96 
 
 
678 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  51.03 
 
 
689 aa  676    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  100 
 
 
681 aa  1384    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  67.35 
 
 
680 aa  947    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  67.84 
 
 
680 aa  955    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  63.84 
 
 
679 aa  828    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  62.26 
 
 
690 aa  831    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  59.12 
 
 
683 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.79 
 
 
682 aa  997    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  44.93 
 
 
652 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  43.56 
 
 
642 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  42.84 
 
 
645 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  40.39 
 
 
647 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  65.33 
 
 
846 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  41.79 
 
 
647 aa  498  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  39.22 
 
 
635 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  39.06 
 
 
635 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  42.3 
 
 
676 aa  475  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  38.36 
 
 
644 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  31.23 
 
 
650 aa  294  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  29.19 
 
 
600 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  31.71 
 
 
587 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.65 
 
 
576 aa  198  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.65 
 
 
576 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
583 aa  191  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  28.32 
 
 
573 aa  181  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.17 
 
 
577 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  30.8 
 
 
554 aa  171  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  26.59 
 
 
574 aa  171  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.13 
 
 
566 aa  170  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.09 
 
 
566 aa  170  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  30.66 
 
 
598 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.79 
 
 
566 aa  164  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  26.43 
 
 
561 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.66 
 
 
575 aa  158  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  26.54 
 
 
561 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  28.69 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  31.01 
 
 
567 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  24.29 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  29.05 
 
 
586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  29.06 
 
 
599 aa  147  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  26.91 
 
 
552 aa  146  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  28.48 
 
 
571 aa  145  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.65 
 
 
542 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.56 
 
 
543 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  27.32 
 
 
556 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.45 
 
 
542 aa  141  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  27.62 
 
 
577 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  29.04 
 
 
553 aa  140  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.38 
 
 
597 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.15 
 
 
577 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  26.71 
 
 
538 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  28.2 
 
 
547 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  25.48 
 
 
584 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  28.5 
 
 
541 aa  136  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  24.66 
 
 
557 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  27.91 
 
 
590 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  29.09 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  23.82 
 
 
561 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.95 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  25.87 
 
 
567 aa  134  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  25.42 
 
 
545 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  24.66 
 
 
558 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  23.99 
 
 
560 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  25.87 
 
 
567 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  23.68 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  27.59 
 
 
564 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  28.05 
 
 
548 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  28.44 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.46 
 
 
540 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  28.09 
 
 
591 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  26.46 
 
 
577 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  26.05 
 
 
546 aa  126  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  28.97 
 
 
566 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  25.85 
 
 
554 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.12 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>