198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0952 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  73.74 
 
 
473 aa  640    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  76.41 
 
 
478 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  76.62 
 
 
469 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  100 
 
 
462 aa  919    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  75.65 
 
 
480 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  73.49 
 
 
461 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  73.49 
 
 
461 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  73.49 
 
 
461 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  70.37 
 
 
461 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  71.68 
 
 
463 aa  611  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  72.33 
 
 
463 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  69.5 
 
 
475 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  69.7 
 
 
459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  62.63 
 
 
463 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  66.88 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  63.08 
 
 
471 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  61.67 
 
 
475 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  62.53 
 
 
469 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  64.39 
 
 
476 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  59.74 
 
 
465 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  60.33 
 
 
511 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  59.06 
 
 
503 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  58.3 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  57.65 
 
 
477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.51 
 
 
464 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.51 
 
 
460 aa  378  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  40.92 
 
 
499 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.77 
 
 
487 aa  360  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.07 
 
 
502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.7 
 
 
475 aa  355  7.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  42.03 
 
 
505 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  48.85 
 
 
510 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  41.68 
 
 
510 aa  342  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  46.58 
 
 
487 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  40.77 
 
 
512 aa  339  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  46.1 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.85 
 
 
486 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  46.84 
 
 
497 aa  322  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  43.73 
 
 
473 aa  313  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.47 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.91 
 
 
304 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  27.74 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  26.44 
 
 
637 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  26.44 
 
 
637 aa  59.3  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.54 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  25 
 
 
334 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.23 
 
 
374 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.64 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.4 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  27.83 
 
 
334 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.22 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.94 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.93 
 
 
340 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.98 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.46 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.71 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.77 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.1 
 
 
334 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.37 
 
 
369 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  28.1 
 
 
334 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  26.1 
 
 
304 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.46 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.02 
 
 
364 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  37.65 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.53 
 
 
340 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  33.82 
 
 
333 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  33.82 
 
 
333 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  33.82 
 
 
333 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.82 
 
 
324 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.47 
 
 
326 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  32.54 
 
 
620 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  27.62 
 
 
334 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.01 
 
 
336 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.91 
 
 
337 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  33.73 
 
 
347 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  28.89 
 
 
337 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  29.14 
 
 
507 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  29.14 
 
 
507 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  29.14 
 
 
507 aa  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.67 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.2 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  31.01 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.42 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.33 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.2 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.42 
 
 
306 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  25 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.39 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.96 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  33.33 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  35.63 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  28.57 
 
 
309 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.47 
 
 
340 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1149  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.55 
 
 
323 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00861618  hitchhiker  0.000070257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0878  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000906257  hitchhiker  0.00000551742 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  25.74 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  28.7 
 
 
507 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>