More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1693 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  72.37 
 
 		 269 aa  238  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  72.37 
 
 		 280 aa  236  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  64.66 
 
 		 157 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  65.89 
 
 		 260 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  65.89 
 
 		 260 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  64.34 
 
 		 272 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  64.34 
 
 		 272 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  64.34 
 
 		 272 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  64.34 
 
 		 272 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  64.34 
 
 		 272 aa  178  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  63.16 
 
 		 234 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  63.16 
 
 		 234 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  63.16 
 
 		 234 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  63.16 
 
 		 305 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  63.16 
 
 		 305 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  57.78 
 
 		 269 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  61.36 
 
 		 251 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  61.36 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  60.61 
 
 		 269 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  61.11 
 
 		 285 aa  171  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  60.61 
 
 		 269 aa  170  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  60.61 
 
 		 251 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  58.02 
 
 		 280 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  57.25 
 
 		 282 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 282 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 272 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  56.92 
 
 		 274 aa  164  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  65.45 
 
 		 165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1661  integrase catalytic region  58.78 
 
 		 148 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  52.55 
 
 		 265 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  52.55 
 
 		 265 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  52.55 
 
 		 265 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  52.55 
 
 		 265 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  51.47 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 279 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 279 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 279 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 279 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  54.14 
 
 		 279 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  52.31 
 
 		 210 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 276 aa  154  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 276 aa  154  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 276 aa  154  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 276 aa  154  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  51.54 
 
 		 276 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  51.45 
 
 		 275 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  51.45 
 
 		 275 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  51.45 
 
 		 275 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  51.45 
 
 		 275 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  47.92 
 
 		 274 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  51.09 
 
 		 269 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  51.54 
 
 		 281 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  50.77 
 
 		 280 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  51.94 
 
 		 282 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  51.94 
 
 		 282 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0188  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0908748  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  48.25 
 
 		 277 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>