82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0859 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0859  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  157  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1876  protein of unknown function DUF339  45.71 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157689  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1482  protein of unknown function DUF339  48.08 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03545  hypothetical protein  42.03 
 
 
86 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2861  hypothetical protein  44.26 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1447  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0934  tetratricopeptide repeat family protein  32.43 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2423  hypothetical protein  33.77 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0871  hypothetical protein  41.43 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.736883  normal  0.107971 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1080  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0411724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2534  hypothetical protein  43.86 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002489  hypothetical protein  40.58 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.864152  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2360  protein of unknown function DUF339  45.28 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1536  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  48.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1336  hypothetical protein  50 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.401477  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1541  hypothetical protein  42.11 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2938  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2254  response regulator receiver domain-containing protein  36.62 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00897791  normal  0.402899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4531  protein of unknown function DUF339  37.1 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0852  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2048  hypothetical protein  38.81 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4760  hypothetical protein  38.36 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54470  hypothetical protein  38.36 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234061  normal  0.929055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1234  hypothetical protein  44.07 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324963  hitchhiker  0.00019787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3159  hypothetical protein  45.83 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000254184  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0812  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.463653  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3030  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3317  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02729  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.166664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3223  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4188  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02692  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.213923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7184  protein of unknown function DUF339  35.38 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0642459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0795  protein of unknown function DUF339  31.17 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0638  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3384  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3204  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3216  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3279  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3282  hypothetical protein  31.17 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4675  protein of unknown function DUF339  36.92 
 
 
98 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1464  hypothetical protein  36.49 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00913316  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1514  hypothetical protein  38.89 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.0228407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6309  hypothetical protein  35.38 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0876  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4162  hypothetical protein  35.48 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3841  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.734664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0873  hypothetical protein  30.67 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1028  hypothetical protein  35.38 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1095  hypothetical protein  40.62 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0188486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1139  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.384538  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4131  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1339  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3315  hypothetical protein  29.87 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3305  hypothetical protein  29.87 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1045  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.453082  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00599  TPR repeat region superfamily  42 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1236  hypothetical protein  42.31 
 
 
79 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1192  hypothetical protein  42.31 
 
 
79 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3121  protein of unknown function DUF339  42.31 
 
 
82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0704763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1358  hypothetical protein  35.62 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476265  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1150  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1269  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2147  protein of unknown function DUF339  32.31 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2775  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3430  hypothetical protein  32.79 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2166  hypothetical protein  60.71 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1064  hypothetical protein  35.14 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410719  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2054  hypothetical protein  33.8 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2546  protein of unknown function DUF339  57.14 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.930387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2857  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1645  hypothetical protein  35.09 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.405471 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2939  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.427354  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1703  hypothetical protein  48.78 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3035  hypothetical protein  44.23 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.380295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2151  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.164508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1486  hypothetical protein  35.53 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4387  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121932  normal  0.80416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1424  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.831953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4297  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.872418  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3898  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.929293  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04680  mitochondrion protein, putative  33.85 
 
 
175 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>