29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3906 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3906  transcription regulator  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  43.01 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  41.94 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  40.22 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  41.46 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  37.61 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  35.79 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  35.48 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  35.05 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0556  hypothetical protein  37.97 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  35.79 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  32.32 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  33 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  36.26 
 
 
116 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0442  regulatory protein ArsR  30.21 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  32.94 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  27.06 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  30.12 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1674  transcriptional regulator TrmB  28.28 
 
 
247 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  30.11 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>