33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3235 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  100 
 
 		 327 aa  671    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  88.07 
 
 		 327 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  68.2 
 
 		 323 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  60.55 
 
 		 323 aa  384  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  65.67 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  31.86 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  32.13 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  30.49 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  29.66 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  29.66 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.3 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  25.32 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  28.57 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  29.39 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  27.64 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  26.58 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  26.69 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  27.12 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  25 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  25.44 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  29.9 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  25.08 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  33.23 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  28.52 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  25.84 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  21.85 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  21.85 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  27.27 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  26.67 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  26.79 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  28.71 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  22.56 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  25.84 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>