36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3007 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  223  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  72.73 
 
 
110 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1872  transcription regulator  46.51 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0352712 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  38.78 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3421  hypothetical protein  37.37 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  40.7 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0407  hypothetical protein  40.7 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  46.67 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1750  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5142  hypothetical protein  37.11 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  34.82 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  41.33 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3278  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1741  hypothetical protein  32.77 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2610  hypothetical protein  33.71 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00563905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1516  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.599896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1920  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  37.21 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0641  transcription regulator  40.79 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0319  transcription regulator  35 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185486  normal  0.0870731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0736  hypothetical protein  39.08 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  35.42 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1979  hypothetical protein  36.25 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.219481  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  34.62 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  35 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0786  transcriptional regulator, ArsR family  28.28 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.965961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  34.43 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  33.72 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  32.79 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  35.37 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  29.73 
 
 
113 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1236  hypothetical protein  31.11 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>