152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3543 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  82.43 
 
 
149 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  72.3 
 
 
149 aa  220  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  67.81 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  63.51 
 
 
148 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  65.07 
 
 
147 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  65.52 
 
 
166 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 
162 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  40.71 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  30.56 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  28.08 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
291 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  28.28 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  27.97 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
310 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  29.8 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  29.33 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  29.8 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  27.08 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.59 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  27.75 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2265  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  32.82 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  22.46 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  25.36 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  37.33 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
237 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  30.85 
 
 
147 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  31.13 
 
 
147 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06378  spermidine n1-acetyltransferase  33.01 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
153 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  29.13 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  30.48 
 
 
320 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.6 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2307  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000603437  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2076  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.16 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.71 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
342 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.88 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1301  acetyltransferase  41.67 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.220294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
174 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  31.73 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  30 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  26.77 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  30.16 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22184  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  28.09 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  30.69 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>