74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1700 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  35 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.12 
 
 
140 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  26.95 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  30.63 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  31.67 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  29.63 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  30 
 
 
185 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  30 
 
 
186 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  28.05 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  30 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0666  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  29.09 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2061  acetyltransferase  36.36 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  26.53 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.49 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  41.94 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  29.2 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  25.85 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000622629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0253991  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.78 
 
 
295 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0606  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
287 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  40.35 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
147 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3579  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
141 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.363377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
174 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  29.76 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5559  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  28.08 
 
 
149 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  26.89 
 
 
140 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  31.16 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  31.71 
 
 
297 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  38.6 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>