189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2370 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 161 aa  328  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  48.63 
 
 		 146 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.492621  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  44.63 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  38.66 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.444089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  29.93 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4804  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2061  acetyltransferase  41.46 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  32.53 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.54 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  30.53 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  30.53 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  30.53 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  29.77 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 		 197 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  32.67 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4257  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2415  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00150831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  32.65 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  27.34 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  31.68 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2743  acetyltransferase  36.9 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3010  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  22.39 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 197 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.634781 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  32.61 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  31.45 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4002  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 		 171 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.37 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4030  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  28.41 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  25.71 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  26.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  28.09 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3272  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  29.61 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0513  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  30.51 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  25.83 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  34.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0811  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214529 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  37.65 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622629 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  37.65 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  39.34 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2495  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  29.47 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  25.93 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2487  acetyltransferase  32.43 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>