134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4171 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  327  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  84.71 
 
 		 163 aa  277  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  56.95 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  56.43 
 
 		 152 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  52.05 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  52.05 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  52.05 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  54.29 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  53.57 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  51.41 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  45.71 
 
 		 146 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  45 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  38.36 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  44.29 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  38.17 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.71 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  35.71 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  41.09 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  36.88 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  40.5 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  40.5 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  33.1 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  34.88 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  37.5 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  29.86 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  38.33 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  35.83 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  30.7 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0855  GNAT family acetyltransferase  32.8 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  26.67 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  28.69 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  25.83 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4020  acetyltransferase, GNAT family  26.89 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3024  acetyltransferase  27.59 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  26.83 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  27.5 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  27.5 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  30.91 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  28.45 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.444089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  26.96 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3579  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.363377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>