21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1612 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1564  hypothetical protein  59.32 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0269  bacteriophage DNA transposition protein B, putative  26.05 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4216  Putative ATPase, transposase-like protein  24.66 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  31.17 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4412  hypothetical protein  33.7 
 
 		 158 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0215  XRE family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.046425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  26.8 
 
 		 388 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4524  B transposition domain-containing protein  26.7 
 
 		 319 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  26 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  26 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2381  AAA ATPase family protein  27.27 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2655  prophage MuSo2, DNA transposition protein, putative  24.21 
 
 		 318 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  24 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  23.68 
 
 		 422 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1664  DNA transposition protein (gpB)  24.26 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  24.48 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2953  hypothetical protein  28.37 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0253  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  42  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0412  putative phage DNA transposition protein  23.35 
 
 		 343 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00594514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>