38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0232 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  88.96 
 
 		 163 aa  299  9e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  81.99 
 
 		 159 aa  274  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  81.99 
 
 		 159 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  79.38 
 
 		 160 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  83.44 
 
 		 160 aa  256  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  81.58 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  63.51 
 
 		 157 aa  194  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  60.93 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  59.56 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  59.85 
 
 		 186 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  56.83 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  53.62 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  57.25 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  57.25 
 
 		 176 aa  157  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  52.9 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  51.32 
 
 		 174 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  51.55 
 
 		 180 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  55.03 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  53.95 
 
 		 161 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  50.31 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  56.34 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  49.69 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  50.97 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  51.91 
 
 		 152 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  45.81 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  44.7 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  41.55 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  44 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  48.09 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  47.73 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  47.33 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  40.91 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  39.85 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  42.47 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  40.41 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  39.61 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  42.42 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>